Η Κάιλ Πρατ, σχεδιάστρια αεροσκαφών, ταξιδεύει με την κόρη της με προορισμό την Αμερική σε ένα αεροσκάφος που μεταφέρει και το φέρετρο με τη σωρό του συζύγου της. Κατά τη διάρκεια της πτήσης, η μικρή εξαφανίζεται και το χειρότερο είναι ότι κανείς δεν φαίνεται να την είχε δει ποτέ μέσα στο αεροπλάνο.
Ο μοναχικός Snake Eyes γίνεται μέλος της αρχαίας ιαπωνικής οικογένειας ονόματι Αρασικάγκε, αφού σώζει τη ζωή του παρόντα διαδόχου τους. Όταν φτάνει στην Ιαπωνία, οι Αρακισάγκε διδάσκουν στον Snake Eyes τους τρόπους ενός πολεμιστή νίντζα, καθώς του προσφέρουν κάτι που ο ίδιος έψαχνε καιρό: ένα σπίτι. Όμως, όταν έρχονται στην επιφάνεια μυστικά από το παρελθόν του, η τιμή και η αφοσίωση του Snake Eyes θα δοκιμαστούν, ακόμα κι αν αυτό σημαίνει να χάσει την εμπιστοσύνη των κοντινών του ανθρώπων.