Η Ασάκο είναι μια νεαρή γυναίκα που γνωρίζει κι ερωτεύεται τρελά τον μονίμως και άσκοπα περιφερόμενο Μπακού, μέχρι που μια μέρα εκείνος εξαφανίζεται από τη ζωή της όσο απρόσμενα είχε εμφανιστεί. Δύο χρόνια μετά, δουλεύοντας στο Τόκιο, η Ασάκο βλέπει τον Μπακού ξανά… ή έτσι νομίζει. Είναι ο νεαρός επιχειρηματίας Ριοχέι που είναι φτυστός ο παλιός έρωτάς της.
Ο ουρανός γίνεται κόκκινος, το έδαφος τρέμει και η Ιαπωνία στέκει στο χείλος της καταστροφής. Όμως, η αποφασισμένη έφηβη Suzume αναλαμβάνει την αποστολή να σώσει τη χώρα της. Με την ικανότητα να βλέπει υπερφυσικές δυνάμεις, αόρατες στα μάτια των υπολοίπων, είναι στο χέρι της να κλείσει τις μυστηριώδεις πόρτες που εξαπολύουν το χάος παντού. Την περιμένει ένα επικίνδυνο ταξίδι καθώς φέρει το βάρος της χώρας στους ώμους της.