Με προορισμό έναν απομακρυσμένο πλανήτη σε ένα μακρινό σημείο του γαλαξία, το πλήρωμα του αποικιακού πλοίου Covenant νομίζει ότι ανακαλύπτει έναν αχαρτογράφητο παράδεισο, αλλά στην πραγματικότητα πρόκειται για έναν σκοτεινό, επικίνδυνο κόσμο. Ο μόνος κάτοικος του οποίου είναι ο «συνθετικός» Ντέιβιντ, επιζών της καταδικασμένης αποστολής Προμηθέας.
Κατά τη διάρκεια των γιορτών, ο Νεντ, ένας υπερπροστατευτικός αλλά τρυφερός πατέρας, και η οικογένειά του επισκέπτονται την κόρη του στο Στάνφορντ, όπου γνωρίζει τον μεγαλύτερό του εφιάλτη: τον καλοπροαίρετο αλλά απροσάρμοστο φίλο της, Λερντ. Μια αντιζηλία ξεκινάει, και συνάμα ο πανικός του Νεντ μεγαλώνει όταν συνειδητοποιεί πόσο χαμένος νιώθει στον πολυτελή κόσμο της τεχνολογίας, αλλά και όταν μαθαίνει ότι ο Λερντ σχεδιάζει να ζητήσει την κόρη του σε γάμο.
Η ταινία διαδραματίζεται στο σύγχρονο Σαν Φρανσίσκο και παρουσιάζει μια σύνθεση επιστημονικής φαντασίας και επιστημονικών γεγονότων με μηνύματα για το μέλλον της ανθρωπότητας. Τα πειράματα του ανθρώπου στην επιστήμη της γενετικής και στη θεραπεία της νόσου του Αλτσχάιμερ οδηγούν στην ανάπτυξη της νοημοσύνης των πιθήκων, που ξεκινούν έναν πόλεμο με στόχο την κυριαρχία τους στον πλανήτη.
Ο Πίτερ Πάρκερ ζει στη Νέα Υόρκη και κάνει μια απόλυτα φυσιολογική ζωή: πηγαίνει στο σχολείο με τον κολλητό του, Χάρι Όσμπορν και είναι ερωτευμένος με τη Μαίρη Κέιτ Γουάτσον. Όλα όμως αλλάζουν, όταν τον τσιμπάει μια γενετικά μεταλλαγμένη αράχνη. Τότε ανακαλύπτει ότι έχει αποκτήσει υπερφυσικές δυνάμεις. Με τις νέες του ικανότητες, ο Πίτερ ορκίζεται να πολεμήσει το έγκλημα και την αδικία. Μεγαλύτερος εχθρός του θα αποδειχθεί ο πατέρας του καλύτερού του φίλου, ο Νόρμαν Όσμπορν, ο κακός Green Goblin. Η μάχη καλού και κακού ανάμεσα στον Spider-Man και τον Green Goblin θα είναι σκληρή και μέχρι τελικής πτώσης…